在AAS测试中的化学干扰可通过化学分离，使用高温火焰，加入释放剂和保护剂，加入缓冲剂或基体改进剂等方法来克服。

从色谱流出曲线上通常可以获得色谱峰的保留值及其区域宽度，可以评价色谱柱的分离效能以及相邻两色谱峰的分离程度，根据色谱峰两峰间的距离，可以评价固定相或流动相的选择是否得当。

在AAS测试中，石墨炉原子化时，灰化的的目的是去除基体，尤其是有机质的去除。在不损失待测原子时，使用尽可能高的温度和长的时间。

不同基团的某一种振动形式可能会在同一频率范围内都有红外吸收。

软电离离子化能量高，分子离子的碎片信息丰富，提供的分子官能团等结构信息。

在AAS测试中的物理干扰可通过配制与试样具有相似组成的标准溶液或标准加入法来克服。

AAS的火焰原子化器具有稳定性高、使用方便等优点。但火焰原子化器的雾化效率较低，原子化效率也低；且基态原子蒸气在火焰吸收区停留时间短，原子蒸气在火焰中被大量气体稀释，使得其灵敏度不高。

火焰原子化器是利用火焰的温度及火焰的氧化还原气氛，将试样中待测元素原子化。

自然变宽和同位素变宽是原子固有的性质所引起，可设法消除。

消除AAS测试中的电离干扰可采用适当控制火焰温度，加入消电离剂（主要为碱金属元素）等来抑制待测原子的电离。